華人科學(xué)家揭示2019-nCoV的潛在T細胞和B細胞表位

來源：米內(nèi)網(wǎng)       點擊量：5452      時間：2020-02-27

截至2020年2月26日，2019-nCoV已經(jīng)感染了超過26個國家的超過77000人，奪走了超過2000條生命。2019-nCoV是一種引起COVID-19的新型冠狀病毒，與SARS-CoV有很高的相似性。目前還沒有針對2019-nCoV或任何形式的冠狀病毒的疫苗被批準(zhǔn)。

圖片來源：bioRxiv

近日來自斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Chen Binbin和Ethan Fast在預(yù)印本網(wǎng)站bioRxiv上發(fā)表了一篇尚未經(jīng)過同行評議的最新文章，題為"Potential T-cell and B-cell Epitopes of 2019-nCoV"。在該文章中，研究人員使用來自結(jié)構(gòu)生物學(xué)和機器學(xué)習(xí)的計算工具來識別基于病毒蛋白抗原和抗體結(jié)合特性的2019-nCoV 的T細胞和B細胞表位。這些表位可用于開發(fā)更有效的疫苗和鑒定中和抗體。

研究人員在人類MHC-I和MHC-II等位基因中鑒定了405個抗原表達分?jǐn)?shù)良好的病毒肽，并在2019-nCoV S蛋白受體結(jié)合域附近發(fā)現(xiàn)了兩個潛在的中和性B細胞表位(440-460和494-506)。通過分析來自四大洲的68個病毒基因組的突變譜，研究人員發(fā)現(xiàn)了96個編碼突變。這些突變更可能發(fā)生在MHC-I表現(xiàn)評分較好的區(qū)域(p=0.02)。在S蛋白受體結(jié)合區(qū)附近不存在突變。最后，研究人員用SARS-CoV實驗數(shù)據(jù)來驗證了我們的計算方法。